Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 FCRLA-202ENST00000294796 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 OR52L1-201ENST00000332249 1094 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 MKL1-204ENST00000402630 747 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 ZNF662-202ENST00000422021 436 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 AC079601.2-201ENST00000547729 775 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 FXYD3-212ENST00000605550 590 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 MIF4GD-214ENST00000618645 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 PITPNB-201ENST00000320996 2826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 DNPEP-220ENST00000523282 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 VRK3-205ENST00000593919 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 A1BG-AS1-203ENST00000594950 1718 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 CXorf40A-203ENST00000422892 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 TMUB2-214ENST00000590235 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 BX005132.1-201ENST00000641403 1580 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 BNIP1-202ENST00000351486 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 RNA5SP248-201ENST00000365602 127 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 GSTM1-204ENST00000369823 852 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 TACR1-202ENST00000409848 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 IFI27L1-203ENST00000553664 647 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 AC048380.1-201ENST00000589818 465 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 MIPEPP1-201ENST00000413533 2027 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 AL590399.1-202ENST00000429818 1480 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 AL512625.1-202ENST00000476224 1480 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 PECR-201ENST00000265322 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 PSMA1-201ENST00000396394 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 SLC37A3-203ENST00000447932 3254 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 KRTAP10-8-201ENST00000334662 876 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 CRYBB2-201ENST00000398215 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 ZNF268-208ENST00000539248 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 ZNF268-212ENST00000542711 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 SNHG21-205ENST00000561107 790 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 AC008764.4-207ENST00000600705 956 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 EVA1A-201ENST00000233712 1815 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 MED27-201ENST00000292035 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 HTR3D-202ENST00000382489 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 SPAG8-201ENST00000340291 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 STRAP-202ENST00000419869 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 MAFTRR-201ENST00000562921 1859 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 AP000487.2-201ENST00000324630 394 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 OR7E122P-201ENST00000383606 1017 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 KRT18P39-201ENST00000415349 1299 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 BCRP5-201ENST00000514371 253 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 LINC01606-208ENST00000521653 557 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 AC011603.2-201ENST00000548149 675 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 PPY-202ENST00000587006 431 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 AC116903.2-201ENST00000561674 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HECW1Q76N89 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms