Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 RUBCN-202ENST00000296343 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 TGM5-207ENST00000622115 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 ZNF287-201ENST00000395824 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 ZCWPW1-208ENST00000490721 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 LDLR-207ENST00000558013 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 UBTF-206ENST00000527034 3010 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 AC135506.1-201ENST00000603877 1799 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 CTAGE7P-201ENST00000435712 2436 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 PPARA-202ENST00000402126 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 TMUB2-205ENST00000587172 1598 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 AC022201.1-201ENST00000452525 577 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 AC026304.1-201ENST00000597953 561 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 PLK4-210ENST00000514379 3060 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 ENO2-209ENST00000538763 1646 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 HIST1H2BH-201ENST00000619466 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 ZNF502-203ENST00000436624 2314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 ITGAL-203ENST00000433423 1416 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 PPP4R3A-206ENST00000554943 3369 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 AC243964.3-201ENST00000623022 2028 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 ASB2-203ENST00000555019 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 DTX2P1-201ENST00000425797 1633 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RBM43Q6ZSC3 DMKN-203ENST00000402589 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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