Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 SPTY2D1-201ENST00000336349 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 VAX1-201ENST00000277905 4494 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 ATP8A1-202ENST00000381668 8270 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 DENND4C-205ENST00000434457 6718 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 GOLGA4-202ENST00000361924 7772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AREL1-201ENST00000356357 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 RAB8B-201ENST00000321437 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 SGK1-220ENST00000524929 2594 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ARHGAP30-201ENST00000368013 4394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 PLEKHH1-201ENST00000329153 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 RNF144B-201ENST00000259939 5036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ZNF667-201ENST00000292069 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 SLC4A5-204ENST00000377634 3814 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HERVK_113P63121 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms