Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 AC005549.1-201ENST00000579438 1629 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 RPUSD4-208ENST00000533628 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 C12orf45-201ENST00000280749 459 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 AREG-201ENST00000395748 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 AP001610.1-201ENST00000411427 1116 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 CHIAP2-202ENST00000449687 669 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 RN7SL328P-201ENST00000484033 300 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 AL160313.2-201ENST00000555875 493 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 AKR1B1P7-201ENST00000587229 952 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 TCF4-AS1-201ENST00000587660 396 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 LILRB4-205ENST00000430952 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 GPR12-201ENST00000381436 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 AC109326.1-201ENST00000624705 1321 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 AC020914.1-201ENST00000396477 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 AC005037.1-202ENST00000332935 820 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 TBC1D3P3-201ENST00000342824 1080 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 HNRNPA1P33-201ENST00000421426 561 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 CIDECP-203ENST00000424691 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 AC114781.1-201ENST00000450559 1028 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 SOX2-OT-201ENST00000460739 609 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 AC027237.4-201ENST00000560870 694 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 AC090772.2-201ENST00000578443 564 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 AL157392.3-218ENST00000600249 773 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 AC021683.4-201ENST00000623348 1099 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 GTF2F2-201ENST00000340473 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 TMEM106A-204ENST00000588659 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 LRRC6-201ENST00000250173 1672 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 PGAP2-235ENST00000532523 1696 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 OR9G1-201ENST00000312153 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 DBI-202ENST00000355857 637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 SNORA9B-201ENST00000384170 133 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 SKA1-203ENST00000417656 1095 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 SYP-AS1-201ENST00000433499 542 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 AL589674.1-201ENST00000454401 222 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 SKAP1-AS1-201ENST00000582246 687 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 MIR7-3HG-204ENST00000588758 865 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 DMRTC1-201ENST00000595412 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 AP003419.3-201ENST00000613900 527 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.76-201ENST00000619429 290 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 LINC00643-207ENST00000637212 734 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 IGF2BP1-202ENST00000431824 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 DMKN-202ENST00000392206 458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
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