Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 ADCY5-201ENST00000309879 2841 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 DIDO1-205ENST00000370371 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 IL36RN-202ENST00000393200 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 CTBP1-AS2-202ENST00000505364 2423 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 RANBP20P-201ENST00000557256 2104 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AIF1L-204ENST00000372300 3284 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 PRTFDC1-201ENST00000320152 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 TNPO2-210ENST00000588216 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AC023355.1-202ENST00000612262 4242 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 PEG10-203ENST00000488574 2587 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 FAM131B-202ENST00000409346 4295 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 FGFR2-212ENST00000369060 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 PHF8-201ENST00000322659 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AC000068.1-201ENST00000431090 2097 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 SMARCAL1-201ENST00000357276 3271 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AC073476.3-201ENST00000563949 2507 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 MAP2K6-206ENST00000590474 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 LINC00473-205ENST00000584911 2212 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 GRIK5-202ENST00000301218 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AIF1L-206ENST00000372302 3340 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 LGR5-202ENST00000536515 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 SIRPG-202ENST00000303415 1716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 SIRPG-204ENST00000381580 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 FAM222B-209ENST00000581407 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 USP5-201ENST00000229268 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 BTD-201ENST00000303498 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 DPF2-202ENST00000415073 2085 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 VPS52-218ENST00000482399 3338 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 KIRREL1-201ENST00000359209 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 POLN-201ENST00000382865 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 LILRB1-208ENST00000427581 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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