Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 NDUFB11-201ENST00000276062 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 TPI1P3-201ENST00000335020 740 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 NPPB-201ENST00000376468 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AC104623.1-201ENST00000446357 546 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 HNRNPA1P55-201ENST00000505935 955 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AL583722.3-201ENST00000553433 503 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AL591368.1-201ENST00000437181 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 GMEB1-201ENST00000294409 1912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 TMEM186-201ENST00000333050 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 RAP1A-201ENST00000356415 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 FANK1-203ENST00000368693 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 PGAM1P10-201ENST00000402426 761 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AL450322.2-201ENST00000421629 759 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AL022725.1-201ENST00000436283 369 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 RPL30P11-202ENST00000509114 358 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AP001107.9-202ENST00000531602 613 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 GOLGA2P10-201ENST00000550961 817 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AC009061.2-202ENST00000602596 696 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AL589743.3-201ENST00000604121 517 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9Y3F1 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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