Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 APOC2-201ENST00000252490 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 TSPEAR-AS2-201ENST00000330490 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 TPT1-203ENST00000379056 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 GNRH2-203ENST00000380346 353 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 IGLV3-21-201ENST00000390308 602 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 AL357054.1-201ENST00000407035 1227 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 WSB1-203ENST00000427287 1149 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 MTND6P9-201ENST00000458075 519 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 LDHAL6CP-201ENST00000502352 1142 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 AC078925.1-201ENST00000535370 568 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 RBP5-202ENST00000542370 564 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 AL132780.2-203ENST00000555294 589 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 AC015563.2-201ENST00000579580 772 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 WSB1-213ENST00000583193 552 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 AC007731.1-203ENST00000583722 474 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 FAM230A-201ENST00000615181 315 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 GH2-205ENST00000622506 702 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 MIPEPP1-201ENST00000413533 2027 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 ALDH3B2-204ENST00000530069 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 CTNNBL1-203ENST00000373473 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 SERPINA1-220ENST00000636712 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 DTX2P1-201ENST00000425797 1633 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 SUGT1-202ENST00000343788 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 AP001922.6-201ENST00000532553 546 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 RN7SL322P-201ENST00000583519 299 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 AC244102.2-201ENST00000597568 955 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 WASH5P-206ENST00000632506 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 HIST1H2APS4-202ENST00000635537 681 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 CCT8-211ENST00000540844 1927 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 KRT40-202ENST00000398486 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 MIR1249-201ENST00000408671 66 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 AC253536.2-201ENST00000423307 254 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 VSTM1-205ENST00000425006 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 RPSAP5-201ENST00000485258 884 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 AC138035.2-201ENST00000509192 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 EGLN3-209ENST00000553215 1004 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 AL137779.3-201ENST00000553295 729 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 FXYD3-207ENST00000604255 780 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 AC007450.4-201ENST00000614709 524 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 LINC02193-207ENST00000621799 723 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 AC069287.1-202ENST00000622626 723 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 ST5-258ENST00000534278 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 CXorf40A-203ENST00000422892 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 ZNF669-204ENST00000448299 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 SERPINB8-209ENST00000636430 1719 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 MIR602-201ENST00000384960 98 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 SYCP3-203ENST00000392927 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 AP001341.1-201ENST00000409758 763 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 KRT18P39-201ENST00000415349 1299 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 ALKBH2-202ENST00000429722 1159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 AC006987.4-201ENST00000430032 279 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 LINC01664-202ENST00000441544 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 PSMD7-205ENST00000568615 931 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 ARL17B-207ENST00000575960 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 AC080038.2-201ENST00000617734 423 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 AC021683.4-201ENST00000623348 1099 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GAPVD1Q14C86 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms