Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 ZCCHC9-203ENST00000407610 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 VWA3B-221ENST00000614454 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 SLC26A5-201ENST00000306312 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 ZFAND1-201ENST00000220669 1798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 ZFAND1-221ENST00000523096 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 PAX6-255ENST00000639386 1723 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1SQ13698 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AC073488.1-201ENST00000416620 1600 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 FKBP4P1-201ENST00000507284 1347 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AHCYP7-201ENST00000560847 1308 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 SGCA-202ENST00000344627 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 TRIM15-206ENST00000376688 426 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 HNRNPA1P68-201ENST00000425806 979 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AC022634.2-201ENST00000521504 382 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AL391832.3-201ENST00000549744 846 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AC022211.3-201ENST00000584339 400 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AC093072.1-201ENST00000589196 602 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 CYP2B7P-202ENST00000593298 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 MRPL34-206ENST00000602206 603 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 OR4C3-202ENST00000611380 597 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 SERPIND1-202ENST00000406799 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AC020914.1-201ENST00000396477 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AL391097.1-201ENST00000432706 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 VGLL1-201ENST00000370634 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 PSMA7-202ENST00000370861 773 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 LINC00544-201ENST00000400540 1031 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 ROM1-205ENST00000534093 862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 PEBP1P1-201ENST00000554856 510 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AL136298.3-201ENST00000556746 445 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 OSGIN1-206ENST00000565123 833 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 C17orf62-234ENST00000584503 584 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 TRIM39-RPP21-201ENST00000623385 1698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 LAMP2-201ENST00000200639 1867 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 PSAT1-201ENST00000347159 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 GGPS1-203ENST00000391855 1407 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 SIRPG-205ENST00000381583 1383 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 LILRA5-201ENST00000432233 1363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 RBMS3-210ENST00000456853 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 FAM90A27P-201ENST00000593323 1370 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 FAM90A28P-202ENST00000597191 1374 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 ABCD3-201ENST00000315713 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 PGAM1P10-201ENST00000402426 761 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AC006059.1-201ENST00000438017 722 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AC139143.1-201ENST00000441772 1207 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AC007622.1-201ENST00000488371 535 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AC010395.2-201ENST00000509899 904 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AP003062.1-201ENST00000528497 762 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 MIR22HG-206ENST00000573127 899 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 MIR4309-201ENST00000582498 83 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AC009041.1-202ENST00000599946 987 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 C2orf27AP1-201ENST00000618128 586 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 CAMK2B-202ENST00000346990 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 MRPL43-202ENST00000318325 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1SQ13698 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
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