Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 DRC7-202ENST00000360716 3041 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 KCNMA1-265ENST00000639591 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 DRC7-203ENST00000394337 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC237221.1-202ENST00000563054 2947 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 POLR1B-216ENST00000537335 4961 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CDC42BPA-203ENST00000366766 10610 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 MAP1A-201ENST00000300231 10258 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 NUSAP1-208ENST00000559596 1629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 DNMT3A-202ENST00000321117 4279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 PIGO-202ENST00000361778 2464 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 SLC26A2-201ENST00000286298 8080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CASP8AP2-205ENST00000551025 6151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 PLCXD1-203ENST00000399012 5287 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AKR1C8P-201ENST00000578467 2182 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 SLC5A10-201ENST00000317977 4436 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 VAT1L-201ENST00000302536 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 DOCK4-204ENST00000428084 7997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 MRPL44-201ENST00000258383 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 BDNF-202ENST00000356660 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 BDNF-218ENST00000533246 4000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 NWD1-206ENST00000552788 6964 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 VPS13A-205ENST00000376636 11145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 DHX30-206ENST00000446256 3660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CADM1-206ENST00000537058 3550 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 ADAM19-201ENST00000257527 6481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 TIAM1-206ENST00000541036 7018 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 MADD-209ENST00000406482 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 RNF125-201ENST00000217740 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms