Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASP4P49662 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASP4P49662 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASP4P49662 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASP4P49662 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASP4P49662 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASP4P49662 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASP4P49662 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CASP4P49662 RBM22P2-201ENST00000393978 1814 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CASP4P49662 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASP4P49662 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CASP4P49662 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASP4P49662 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASP4P49662 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASP4P49662 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASP4P49662 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CASP4P49662 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASP4P49662 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASP4P49662 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASP4P49662 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CASP4P49662 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASP4P49662 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASP4P49662 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASP4P49662 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASP4P49662 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASP4P49662 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASP4P49662 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASP4P49662 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASP4P49662 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CASP4P49662 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASP4P49662 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASP4P49662 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASP4P49662 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASP4P49662 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASP4P49662 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASP4P49662 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASP4P49662 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASP4P49662 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CASP4P49662 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 PPM1K-201ENST00000295908 1940 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CASP4P49662 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms