Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 KCNK16-202ENST00000373229 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 LIMS2-203ENST00000409254 867 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 AC016650.1-201ENST00000502834 708 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 AC087441.1-201ENST00000531069 301 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 STAMBP-211ENST00000536064 845 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 AC109460.2-202ENST00000568057 573 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 AC006236.1-201ENST00000576249 797 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 HKR1-222ENST00000591417 525 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 AC087893.1-201ENST00000612818 664 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 MFSD12-215ENST00000615613 688 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 AP000897.1-201ENST00000584036 1613 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 ASS1-201ENST00000352480 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 TUBD1-203ENST00000346141 1490 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 TUBB8P5-201ENST00000445286 1351 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 AC106872.1-201ENST00000512492 1360 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 OR7E33P-201ENST00000437705 966 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 LINC01324-202ENST00000497379 838 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 HOPX-209ENST00000508121 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 AC005086.1-201ENST00000566572 801 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 TRMT112P6-201ENST00000599234 372 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 RHOH-219ENST00000614836 2114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 BX005132.1-201ENST00000641403 1580 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 IST1-221ENST00000544564 1500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 C19orf38-201ENST00000397820 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 LINC00424-201ENST00000413124 654 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 SYNPR-AS1-201ENST00000488201 558 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 MIOXP1-201ENST00000521205 835 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 DEGS2-202ENST00000553834 421 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 AC100830.3-201ENST00000583044 554 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 GMNN-207ENST00000620958 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 SMYD5-209ENST00000629411 246 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 JAML-202ENST00000356289 1944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 GGNBP1-201ENST00000374458 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 HNRNPA1P34-201ENST00000391992 950 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 IL32-204ENST00000396887 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 RPS7-202ENST00000403564 764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 PPP1R7-206ENST00000406106 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 PQLC1P1-201ENST00000434950 429 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 AC009312.1-201ENST00000457110 592 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 LINC00877-202ENST00000464271 552 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 AP000926.2-201ENST00000469983 358 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 RN7SL255P-201ENST00000470639 296 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 RN7SL313P-201ENST00000497618 288 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 AC140658.2-201ENST00000566360 348 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 ACAP1-204ENST00000570504 274 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 PDZRN3-AS1-202ENST00000608304 774 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 RN7SK-201ENST00000636484 328 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 C8orf86-202ENST00000437935 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRMP28827 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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