Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 ARHGEF9-220ENST00000635729 1761 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAF6Q9Y4K3 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 ZNF771-204ENST00000566625 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAF6Q9Y4K3 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms