Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 UBTF-206ENST00000527034 3010 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 ADAMTS10-211ENST00000597188 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 DNAH2-202ENST00000570791 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 CEACAM20-203ENST00000614924 1809 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 MIS12-202ENST00000573759 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 TMEM246-202ENST00000374848 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 AL845472.1-202ENST00000624675 4080 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 SMG8-202ENST00000543872 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 SLC25A13-202ENST00000416240 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 GOLGA8O-201ENST00000509311 1997 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 FLJ30679-201ENST00000624773 1980 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 RBM39-243ENST00000528062 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 LRTM2-201ENST00000299194 3688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 CDCA2-202ENST00000380665 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 PTCD2-212ENST00000543322 2029 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 NLRP7-202ENST00000340844 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 DUSP22-211ENST00000604971 3824 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 CHGB-201ENST00000378961 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 PLA2G4E-AS1-201ENST00000499478 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 GRIK1-206ENST00000399913 3234 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 CIZ1-205ENST00000372948 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 ATL2-201ENST00000378954 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 CASC15-204ENST00000606197 3969 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 UNC93A-201ENST00000230256 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 AL162391.1-201ENST00000419853 2102 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 CPLX4-202ENST00000587244 1916 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 ZNF667-201ENST00000292069 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms