Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 OR2C1-201ENST00000304936 1406 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 CBWD3-206ENST00000478048 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 MDP1-201ENST00000288087 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 FATE1-201ENST00000370350 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AL445070.1-201ENST00000414631 714 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 HTATSF1P1-201ENST00000432008 984 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AL139412.1-201ENST00000441085 523 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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PCDH10Q9P2E7 LNX1-AS2-202ENST00000509974 628 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PCDH10Q9P2E7 AC009630.2-202ENST00000578500 884 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AC024267.5-201ENST00000579154 599 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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PCDH10Q9P2E7 AP001010.1-201ENST00000588397 538 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AC064862.6-203ENST00000605139 691 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PCDH10Q9P2E7 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PCDH10Q9P2E7 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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PCDH10Q9P2E7 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PCDH10Q9P2E7 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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PCDH10Q9P2E7 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 LMO7DN-201ENST00000318245 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AC246787.2-202ENST00000418566 370 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 LINC01697-204ENST00000458316 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AC113346.2-201ENST00000502684 457 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 RPS23-205ENST00000510019 1019 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AC131902.1-201ENST00000521558 594 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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