Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGAP1Q96PV0 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms