Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 LRCH1-203ENST00000389798 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 LINC02133-202ENST00000569726 2626 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 COL12A1-202ENST00000345356 5886 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 PPIL2-201ENST00000335025 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 C4orf33-201ENST00000281146 6170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 SGSM1-201ENST00000400358 6643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 LAMA4-207ENST00000424408 5983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 PNPLA7-202ENST00000406427 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 TNRC6C-211ENST00000636222 7093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 RPL27A-201ENST00000314138 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 ASB7-201ENST00000332783 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 SHMT2-201ENST00000328923 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 VAT1L-201ENST00000302536 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 SEMA6A-AS1-206ENST00000514214 782 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 RAB3IP-212ENST00000550536 9646 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 CYP4F11-201ENST00000248041 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
ZNF479Q96JC4 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms