Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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HERC3Q15034 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 ARHGEF9-226ENST00000636392 1920 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC3Q15034 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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