Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM4P67936 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM4P67936 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM4P67936 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM4P67936 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM4P67936 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM4P67936 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM4P67936 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM4P67936 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM4P67936 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM4P67936 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM4P67936 ZNF773-205ENST00000599847 5832 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM4P67936 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM4P67936 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM4P67936 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM4P67936 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM4P67936 AL845472.1-202ENST00000624675 4080 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 DLEC1-201ENST00000308059 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 MROH7-TTC4-201ENST00000414150 5867 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 ZNF646-201ENST00000300850 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 CDC6-201ENST00000209728 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 SCAF8-203ENST00000417268 4944 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 PDE7B-201ENST00000308191 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 COL19A1-205ENST00000620364 6233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 COBLL1-202ENST00000375458 9367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TPM4P67936 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM4P67936 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM4P67936 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM4P67936 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM4P67936 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM4P67936 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM4P67936 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM4P67936 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM4P67936 FN1-202ENST00000336916 8435 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM4P67936 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM4P67936 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM4P67936 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM4P67936 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM4P67936 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM4P67936 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM4P67936 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM4P67936 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM4P67936 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM4P67936 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM4P67936 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM4P67936 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM4P67936 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM4P67936 IL21R-201ENST00000337929 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM4P67936 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM4P67936 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM4P67936 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM4P67936 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM4P67936 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM4P67936 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM4P67936 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM4P67936 SLC35B4-201ENST00000378509 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM4P67936 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM4P67936 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM4P67936 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM4P67936 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM4P67936 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM4P67936 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM4P67936 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TPM4P67936 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms