Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 RIBC1-203ENST00000414955 1281 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 LINC00332-201ENST00000455241 834 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 CDK2AP2P2-201ENST00000478512 367 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 CARS-216ENST00000639317 135 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 AL662907.1-201ENST00000622988 1360 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 SLC26A5-211ENST00000432958 2588 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 TRAV38-2DV8-201ENST00000390465 395 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 OR2A14-201ENST00000408899 1012 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 FAM45BP-201ENST00000408950 1074 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 SLC25A5P6-201ENST00000515328 886 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 LMO1-204ENST00000534484 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 AL133297.2-201ENST00000563162 485 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 AC006236.1-201ENST00000576249 797 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 RPL37A-212ENST00000600880 425 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 CLU-202ENST00000405140 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 CEP70-208ENST00000474781 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 NNMT-201ENST00000299964 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 NBR2-202ENST00000460115 1344 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 AC006262.1-201ENST00000593980 1316 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 TRMT61B-201ENST00000306108 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 RBM14-203ENST00000409372 876 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 AC004112.1-201ENST00000431064 561 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 CITED1-206ENST00000431381 941 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 CITED1-207ENST00000445983 820 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 RANBP6-202ENST00000485372 1000 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 TPI1P2-201ENST00000491343 752 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 CLDND1-223ENST00000511081 642 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 AP001979.1-201ENST00000529222 751 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 AP000753.1-201ENST00000542805 573 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 ZNF415-221ENST00000600574 563 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 Metazoa_SRP.97-201ENST00000618280 304 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 AL109618.3-201ENST00000622748 430 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 PLXNA4-203ENST00000378539 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 C16orf46-202ENST00000378611 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 SPINK2-201ENST00000248701 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 GAPDH-202ENST00000396856 1266 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 AC083873.1-201ENST00000421179 1099 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 TUSC8-201ENST00000432701 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 CHIAP2-202ENST00000449687 669 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 FAM153C-208ENST00000511189 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 ALG1L14P-201ENST00000514230 434 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 EXTL3-AS1-204ENST00000523789 543 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 EIF3K-213ENST00000593149 760 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 FAM95B1-214ENST00000593216 759 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 PRIM1-201ENST00000338193 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 ZNF555-203ENST00000591539 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 AL391987.4-201ENST00000377547 439 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 TPT1-203ENST00000379056 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 AC074085.2-201ENST00000416734 428 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 AL355493.1-201ENST00000422707 808 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 674 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 RN7SL225P-201ENST00000464648 298 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 ELOBP2-201ENST00000526184 355 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 LINC00868-203ENST00000592919 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 AC010531.7-201ENST00000602665 465 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 LINC02193-207ENST00000621799 723 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 AC069287.1-202ENST00000622626 723 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 ATXN10-212ENST00000640901 1185 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMARCA4P51532 CXorf40B-203ENST00000370406 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms