Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 KLF8-202ENST00000374928 4821 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SPOCK3-203ENST00000421836 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 RIN2-201ENST00000255006 4505 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SMARCE1-202ENST00000348513 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 MADD-209ENST00000406482 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 TOR1AIP1-212ENST00000606911 8704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 CDH11-212ENST00000566827 2395 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 SCNM1-202ENST00000368905 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 LINC02204-201ENST00000630447 3206 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
VPREB1P12018 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms