Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 MRPL36-201ENST00000382647 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 ALDOA-229ENST00000636698 420 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 ZSCAN5DP-201ENST00000600684 1488 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 CCDC175-201ENST00000281581 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 AC022201.1-201ENST00000452525 577 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 CDCA7L-201ENST00000356195 2915 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PIK3CDO00329 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms