Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 GOLGA8G-203ENST00000525590 2009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 GOLGA8F-202ENST00000532622 2009 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 CCDC42-201ENST00000293845 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 IGHVII-33-1-201ENST00000524010 280 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 ZNF33A-205ENST00000469037 1530 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 TPRG1-AS2-201ENST00000425454 479 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 AC079336.3-201ENST00000577227 475 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 DDX11L1-202ENST00000456328 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 DDX11L10-202ENST00000513886 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 DDX11L9-203ENST00000562189 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 SLC25A51P3-201ENST00000521814 889 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 RUFY2-201ENST00000265865 2033 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 ANKDD1A-207ENST00000496660 1477 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRNP3Q8WYN3 AL391097.1-201ENST00000432706 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms