Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 MYO1C-202ENST00000361007 4734 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 CCDC144A-204ENST00000360524 5830 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 RBM33-207ENST00000401878 10149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 SCO1-201ENST00000255390 9612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 CCDC144A-206ENST00000399273 8686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 MXRA5Y-201ENST00000420610 8000 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 CABIN1-203ENST00000398319 7480 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RRN3P1Q2M238 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms