Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 RASAL2-201ENST00000367649 4378 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 ZNF552-201ENST00000391701 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 ISL1-201ENST00000230658 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 DRC1-201ENST00000288710 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 NTRK3-204ENST00000360948 3004 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 CEP83-201ENST00000339839 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 PEG10-203ENST00000488574 2587 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 MVK-213ENST00000625889 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 PAK1-202ENST00000356341 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 SRP68-212ENST00000602720 2037 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 DCK-204ENST00000504952 2614 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 MYT1-202ENST00000360149 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 PHF8-201ENST00000322659 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 USP36-202ENST00000449938 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 LINC01254-201ENST00000566225 2908 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 UNC13D-202ENST00000412096 3648 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 SRRT-216ENST00000618262 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 ARL8B-202ENST00000419534 1684 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 ENTPD3-203ENST00000445129 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AC093583.1-201ENST00000462083 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 DLEU1-231ENST00000490577 2440 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 HADH-210ENST00000626637 1774 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 LRSAM1-202ENST00000323301 3376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AP2A1-201ENST00000354293 3388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 EPB41L1-203ENST00000373941 2652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 MED24-203ENST00000394127 3456 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 ANKRA2-201ENST00000296785 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 RNF10-201ENST00000325954 3825 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 PUDP-201ENST00000381077 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 LPIN1-209ENST00000449576 3077 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 TRMT12-201ENST00000328599 2207 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 SLC3A1-205ENST00000409387 2334 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 NR2F1-AS1-213ENST00000607797 3380 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 KDM8-201ENST00000286096 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 RUNX2-AS1-201ENST00000563807 1513 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 HEXIM1-201ENST00000332499 3600 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 AC006144.1-201ENST00000424220 1600 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 NAT10-202ENST00000527971 1600 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 PRAMEF27-201ENST00000436041 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 BANK1-201ENST00000322953 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 C9orf64-201ENST00000314700 2067 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 TSPAN6-201ENST00000373020 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 PDIA6-204ENST00000404824 2236 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 NFXL1-201ENST00000329043 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 TRMT10B-201ENST00000297994 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 MLPH-202ENST00000338530 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 NR2E1-201ENST00000368983 2612 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 RNF13-203ENST00000392894 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 SLC12A8-202ENST00000430155 2831 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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