Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AC090093.1-201ENST00000611315 271 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 WASH5P-206ENST00000632506 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 PECR-201ENST00000265322 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 GABPB1-206ENST00000543881 1450 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 ATAT1-204ENST00000330083 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 TFG-202ENST00000418917 1716 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 GJB1-202ENST00000374022 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 AC100774.1-201ENST00000565581 1603 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 OAZ3-201ENST00000321531 851 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 PARK7-204ENST00000377493 795 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 MIR602-201ENST00000384960 98 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 GEMIN8-203ENST00000398355 1119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 AC010442.2-201ENST00000509301 407 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 AC044839.1-201ENST00000532307 541 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 AP001922.6-201ENST00000532553 546 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 GMNN-207ENST00000620958 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 GSDMB-201ENST00000309481 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 ACRBP-202ENST00000414226 1700 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 PPARG-206ENST00000397012 2006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 TMEM107-201ENST00000316425 756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 PRSS3-203ENST00000379405 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 CAPG-204ENST00000409724 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 AC092100.1-201ENST00000435148 702 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 TSACC-206ENST00000466306 477 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 NREP-218ENST00000509427 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 CSRP1-219ENST00000533432 1149 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 COPZ1-206ENST00000549043 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 AC008915.2-201ENST00000570080 730 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 AC005154.1-202ENST00000578293 999 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 MIR1587-201ENST00000583319 53 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 AC105105.4-201ENST00000610389 713 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 ZFP37-203ENST00000555206 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 ZNF669-204ENST00000448299 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 ZNF816-201ENST00000270457 582 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 IMMP1L-201ENST00000278200 795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 FKBP1A-201ENST00000381715 705 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 PRKCE-202ENST00000394874 996 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 AC004771.1-201ENST00000438266 583 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 SNHG14-207ENST00000452731 1064 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 PFN1P10-201ENST00000455962 327 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 PARVG-208ENST00000466375 820 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 RPSAP5-201ENST00000485258 884 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 AZU1P1-201ENST00000603479 385 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 HYLS1-201ENST00000356438 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 CABYR-203ENST00000399496 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 DAP3-203ENST00000421487 1470 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 APOC2-201ENST00000252490 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 AC006987.4-201ENST00000430032 279 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 AC007690.1-201ENST00000451924 468 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 AC073465.1-201ENST00000456671 464 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 RN7SL148P-201ENST00000467120 279 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 AC096713.1-201ENST00000514650 978 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 CDK2AP1-204ENST00000538446 1161 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 MNAT1-202ENST00000539616 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 FXYD3-207ENST00000604255 780 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 MAGED2-205ENST00000375060 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 PAX6-217ENST00000481563 1587 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms