Protein–RNA interactions for Protein: P20936

RASA1, Ras GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA1P20936 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RASA1P20936 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RASA1P20936 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASA1P20936 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASA1P20936 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RASA1P20936 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASA1P20936 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASA1P20936 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASA1P20936 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RASA1P20936 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RASA1P20936 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RASA1P20936 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RASA1P20936 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASA1P20936 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASA1P20936 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASA1P20936 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASA1P20936 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASA1P20936 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASA1P20936 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASA1P20936 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASA1P20936 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASA1P20936 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASA1P20936 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASA1P20936 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RASA1P20936 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RASA1P20936 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 ITGB1BP1-201ENST00000238091 1772 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RASA1P20936 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASA1P20936 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASA1P20936 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASA1P20936 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASA1P20936 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASA1P20936 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASA1P20936 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASA1P20936 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASA1P20936 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RASA1P20936 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RASA1P20936 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASA1P20936 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASA1P20936 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASA1P20936 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASA1P20936 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASA1P20936 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RASA1P20936 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASA1P20936 LINC00484-201ENST00000414768 561 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASA1P20936 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RASA1P20936 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RASA1P20936 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RASA1P20936 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASA1P20936 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASA1P20936 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASA1P20936 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RASA1P20936 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms