Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CTLA4P16410 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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