Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AS3MT-202ENST00000615257 1723 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HOXD8P13378 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC024475.2-201ENST00000312173 879 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 ULBP3-201ENST00000367339 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 RPS7-202ENST00000403564 764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC096536.3-201ENST00000415336 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 DMKN-244ENST00000480502 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 KRT18P42-201ENST00000505048 1255 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 IL32-230ENST00000551122 733 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AL391097.1-201ENST00000432706 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 VOPP1-206ENST00000428097 1671 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 MRPL43-202ENST00000318325 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 NDUFAF6-201ENST00000396111 1869 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 FAM183BP-201ENST00000409072 1595 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 OLAH-203ENST00000378228 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 Z98259.1-201ENST00000564261 1697 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 SNORA30.1-201ENST00000363193 129 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 CD74-203ENST00000377795 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC098649.1-201ENST00000427258 569 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC016650.1-201ENST00000502834 708 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 METTL23-211ENST00000589977 617 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC026304.1-201ENST00000597953 561 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms