Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 IL12A-AS1-203ENST00000497452 2425 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 GGTA1P-205ENST00000495328 3478 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 LRTM2-201ENST00000299194 3688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 AXIN2-209ENST00000618960 4060 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 FGF23-201ENST00000237837 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 GRID2-201ENST00000282020 6117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 SERPING1-203ENST00000378323 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 DFFB-201ENST00000338895 3105 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 GDPD5-202ENST00000443276 3106 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 ANKRA2-201ENST00000296785 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 DAND5-201ENST00000317060 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 C1orf216-201ENST00000270815 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 PNMA5-203ENST00000439251 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 IQSEC1-204ENST00000613206 3582 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 GPR179-204ENST00000621958 7983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 DGCR5-203ENST00000438934 5492 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTS10-211ENST00000597188 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 CHGB-201ENST00000378961 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HMGB1P1B2RPK0 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 NCDN-203ENST00000373253 3677 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 NLRP7-202ENST00000340844 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 SHMT2-205ENST00000553474 1765 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 CASC15-204ENST00000606197 3969 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 ARAP1-209ENST00000455638 2683 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 GFRA1-203ENST00000369236 9109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 LINC01134-202ENST00000439488 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 NDRG1-222ENST00000522476 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A25-204ENST00000373069 3376 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 HYOU1-221ENST00000621959 3358 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 FURIN-201ENST00000268171 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 REPS1-205ENST00000415951 2424 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 CICP19-201ENST00000632944 2357 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 SPCS2-209ENST00000610881 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 PHLPP2-204ENST00000567016 4812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AL357054.4-201ENST00000606285 2814 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 SERPINA1-205ENST00000404814 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 FAM161A-203ENST00000405894 3684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 SRP19-206ENST00000515463 660 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 ZNF221-205ENST00000622072 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 AFG3L2P1-201ENST00000521792 1763 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 LDLR-207ENST00000558013 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 C10orf76-202ENST00000370033 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HMGB1P1B2RPK0 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.7 ms