Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS5

EPB41L4A, Band 4.1-like protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L4AQ9HCS5 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EPB41L4AQ9HCS5 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPB41L4AQ9HCS5 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPB41L4AQ9HCS5 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EPB41L4AQ9HCS5 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EPB41L4AQ9HCS5 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPB41L4AQ9HCS5 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPB41L4AQ9HCS5 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPB41L4AQ9HCS5 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPB41L4AQ9HCS5 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPB41L4AQ9HCS5 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPB41L4AQ9HCS5 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPB41L4AQ9HCS5 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EPB41L4AQ9HCS5 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPB41L4AQ9HCS5 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPB41L4AQ9HCS5 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPB41L4AQ9HCS5 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPB41L4AQ9HCS5 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPB41L4AQ9HCS5 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPB41L4AQ9HCS5 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPB41L4AQ9HCS5 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPB41L4AQ9HCS5 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPB41L4AQ9HCS5 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPB41L4AQ9HCS5 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPB41L4AQ9HCS5 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPB41L4AQ9HCS5 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPB41L4AQ9HCS5 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPB41L4AQ9HCS5 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPB41L4AQ9HCS5 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPB41L4AQ9HCS5 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPB41L4AQ9HCS5 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
EPB41L4AQ9HCS5 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPB41L4AQ9HCS5 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 SERPING1-202ENST00000340687 1719 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 RBM22P2-201ENST00000393978 1814 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB41L4AQ9HCS5 SMYD5-209ENST00000629411 246 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms