Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM47Q96LD4 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM47Q96LD4 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM47Q96LD4 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM47Q96LD4 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM47Q96LD4 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM47Q96LD4 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM47Q96LD4 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM47Q96LD4 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM47Q96LD4 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM47Q96LD4 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM47Q96LD4 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM47Q96LD4 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM47Q96LD4 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM47Q96LD4 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM47Q96LD4 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM47Q96LD4 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM47Q96LD4 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM47Q96LD4 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM47Q96LD4 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM47Q96LD4 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM47Q96LD4 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM47Q96LD4 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM47Q96LD4 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM47Q96LD4 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM47Q96LD4 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM47Q96LD4 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM47Q96LD4 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM47Q96LD4 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM47Q96LD4 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM47Q96LD4 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM47Q96LD4 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms