Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 WDR37-201ENST00000263150 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 PLEKHG5-208ENST00000400915 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 ZNF23-201ENST00000357254 3186 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 SNU13-203ENST00000401959 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 PIGG-201ENST00000310340 3203 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 ELN-205ENST00000358929 3967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 ZNF135-201ENST00000313434 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 SPAG5-201ENST00000321765 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 MCM5-202ENST00000382011 2402 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 RDH16-202ENST00000398138 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 SLC5A11-209ENST00000567758 2246 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 NEK6-213ENST00000540326 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 UCP3-201ENST00000314032 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 FP565324.1-201ENST00000636427 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 ZNF542P-207ENST00000495307 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 ERP44-201ENST00000262455 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 AC102953.1-201ENST00000445345 498 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 CLPB-201ENST00000294053 3240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 PIK3R5-202ENST00000447110 4495 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 FBLN2-201ENST00000295760 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 ALPL-203ENST00000374832 2193 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 RGL4-209ENST00000612432 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 TUBGCP2-201ENST00000252936 3885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 LILRB2-204ENST00000391749 2286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 ITGB6-204ENST00000409967 2292 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 LINC01159-201ENST00000433433 3103 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 PTCD2-211ENST00000536805 1911 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 RHCG-201ENST00000268122 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 KLHL38-201ENST00000325995 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 AP000897.1-201ENST00000584036 1613 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 POLR1B-201ENST00000263331 4558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
LSAMPQ13449 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 LRRC8E-206ENST00000618098 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
LSAMPQ13449 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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