Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 MPI-208ENST00000563786 1707 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 AC064836.1-201ENST00000405197 704 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 PTS-204ENST00000525803 625 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 AC136475.6-201ENST00000533113 289 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 GABARAPL1-203ENST00000535576 792 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 RN7SL732P-201ENST00000581157 300 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 AC091941.1-201ENST00000623003 576 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 ACR-201ENST00000216139 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 ENO3-201ENST00000323997 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 IL17RB-201ENST00000288167 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 APTX-206ENST00000379825 2023 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 ACAA2-205ENST00000587994 1657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 FHL2-208ENST00000409807 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 CTNNBL1-203ENST00000373473 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 ALX1-201ENST00000316824 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 TPD52L3-203ENST00000381428 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 RBM4-202ENST00000396053 1337 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 RPS21-202ENST00000370562 1002 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 TOMM5-202ENST00000377773 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 HNRNPA1P19-201ENST00000405292 370 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 AC099681.2-201ENST00000449899 543 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 RN7SL43P-201ENST00000463926 291 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 GAPDHP76-201ENST00000512278 976 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 AC015936.1-201ENST00000591013 1028 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 AP006621.5-202ENST00000623692 636 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 UGT1A1-201ENST00000305208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 PABPC1P2-201ENST00000471997 1805 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 ST5-258ENST00000534278 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 MRPL55-213ENST00000366740 644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 TCTE1-201ENST00000371504 616 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 IGLV3-21-201ENST00000390308 602 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 NDFIP2-AS1-201ENST00000457171 431 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 AC011603.2-201ENST00000548149 675 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 AL031058.1-201ENST00000561592 888 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 NRSN2-205ENST00000608467 504 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 UBR1-212ENST00000627960 189 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 GPHN-202ENST00000459628 1723 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 SFTPA1-203ENST00000428376 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 VRK3-205ENST00000593919 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMARCA4P51532 MEFV-209ENST00000541159 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 SMARCB1-203ENST00000407082 1182 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 CYP2F2P-201ENST00000437853 1056 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 TMEM91-206ENST00000447302 721 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 PIEZO1P1-201ENST00000485427 219 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 AC138035.2-201ENST00000509192 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 OR5BA1P-201ENST00000529722 982 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 KRTAP2-2-202ENST00000542910 390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 AC078880.3-201ENST00000603439 1121 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 LILRA2-204ENST00000391738 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 PSMD13-201ENST00000352303 1427 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 ATP6V1B1-AS1-201ENST00000422761 1129 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 LINC01046-201ENST00000443719 405 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 LAMTOR5-203ENST00000474861 1154 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 MOG-229ENST00000483013 279 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 MOG-232ENST00000490427 327 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 AC027290.1-201ENST00000537827 484 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 AL160313.2-201ENST00000555875 493 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMARCA4P51532 DNM1P50-201ENST00000565767 508 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms