Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GCLCP48506 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GCLCP48506 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GCLCP48506 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GCLCP48506 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GCLCP48506 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GCLCP48506 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GCLCP48506 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GCLCP48506 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GCLCP48506 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GCLCP48506 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GCLCP48506 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GCLCP48506 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GCLCP48506 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms