Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 MCM7-201ENST00000303887 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 ZMAT4-202ENST00000315769 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 SLC18A1-201ENST00000265808 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 RPL13-201ENST00000311528 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 CLTCL1-210ENST00000617926 1695 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 CIZ1-225ENST00000538431 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 SEPT9-204ENST00000427180 3635 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 ORMDL2-201ENST00000243045 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 FDXACB1-201ENST00000260257 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 ACSM5-201ENST00000331849 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 AP1B1-203ENST00000402502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 TRPC7-203ENST00000502753 2424 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 RBM39-243ENST00000528062 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 MX1-201ENST00000288383 2733 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 TOMM40L-202ENST00000367988 2708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 MAN2B1-201ENST00000221363 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 UEVLD-213ENST00000543987 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 XAB2-201ENST00000358368 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 DPP3-215ENST00000541961 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 ZNF789-209ENST00000483089 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 PLK4-209ENST00000513090 3123 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 TP53-208ENST00000504290 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 TP53-220ENST00000610623 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 SLC4A9-201ENST00000432095 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CTRB1P17538 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 KCNH7-201ENST00000328032 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 SDCCAG8-201ENST00000366541 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 UBE2L3-201ENST00000342192 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 MCAM-201ENST00000264036 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 RAB43-203ENST00000393305 4215 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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