Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LRP2BPQ9P2M1 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRP2BPQ9P2M1 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LRP2BPQ9P2M1 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRP2BPQ9P2M1 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRP2BPQ9P2M1 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LRP2BPQ9P2M1 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms