Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHPF2Q9P2E5 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHPF2Q9P2E5 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHPF2Q9P2E5 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHPF2Q9P2E5 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHPF2Q9P2E5 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHPF2Q9P2E5 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHPF2Q9P2E5 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHPF2Q9P2E5 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHPF2Q9P2E5 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHPF2Q9P2E5 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHPF2Q9P2E5 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHPF2Q9P2E5 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHPF2Q9P2E5 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHPF2Q9P2E5 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHPF2Q9P2E5 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHPF2Q9P2E5 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHPF2Q9P2E5 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms