Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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FANCFQ9NPI8 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FANCFQ9NPI8 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
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