Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZCCHC17Q9NP64 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZCCHC17Q9NP64 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms