Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RN7SL87P-201ENST00000497657 288 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AL589666.1-201ENST00000503906 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC004923.4-201ENST00000532296 739 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02352-201ENST00000557928 468 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC046168.2-202ENST00000561123 926 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC002511.3-201ENST00000638098 420 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC33-201ENST00000268082 2093 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 MYT1-202ENST00000360149 2061 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00327-201ENST00000443778 2087 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TSPEAR-203ENST00000613245 3524 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 POTEH-201ENST00000343518 1928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 EIF2A-214ENST00000487799 1913 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AIF1L-201ENST00000247291 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 FAS-204ENST00000355740 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 CD5-201ENST00000347785 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 AC005072.1-201ENST00000606640 1779 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
KRTAP21-1Q3LI58 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms