Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 HERC2P3-204ENST00000426501 5995 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 FBXO22-201ENST00000308275 10725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 TNRC6C-201ENST00000301624 9632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 CXorf38-203ENST00000378426 4895 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 SLC26A4-201ENST00000265715 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 GPR179-203ENST00000616987 7980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 CEP68-201ENST00000260569 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 LAMA4-207ENST00000424408 5983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 SLC26A2-201ENST00000286298 8080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
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