Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ENTPD3-203ENST00000445129 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 FAM95B1-212ENST00000592873 4692 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 TPO-204ENST00000382198 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 HIST1H2BH-201ENST00000619466 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 POC1B-GALNT4-202ENST00000548729 5436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AL591926.3-201ENST00000611630 238 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 XRCC3-202ENST00000553264 3018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 MFSD11-201ENST00000336509 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 TTN-AS1-209ENST00000456053 2033 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 NRF1-202ENST00000311967 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SSBP1Q04837 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 SMIM21-202ENST00000579022 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 TBC1D3F-201ENST00000620210 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 ARHGEF9-235ENST00000637723 2146 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 CFAP65-204ENST00000410037 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 GOLGA6L7P-201ENST00000567390 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 POTEI-203ENST00000631234 2072 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 UBE2L3-204ENST00000545681 2932 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 LAMB3-201ENST00000356082 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 TRO-202ENST00000319167 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 TRO-203ENST00000375022 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 DAND5-201ENST00000317060 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 BOLL-201ENST00000282278 2742 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SSBP1Q04837 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms