Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 GRIA4-202ENST00000393125 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 AC096564.1-201ENST00000499098 2810 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 ARHGEF3-213ENST00000496106 1994 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 TRIM37-203ENST00000393066 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 MISP-201ENST00000215582 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 FGFR2-212ENST00000369060 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 MOB3C-201ENST00000271139 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 CCDC163-203ENST00000626657 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
GGTLC3B5MD39 TTC4-201ENST00000371281 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms