Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N9

USH1C, Harmonin, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1CQ9Y6N9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USH1CQ9Y6N9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USH1CQ9Y6N9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms