Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PARP3Q9Y6F1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PARP3Q9Y6F1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PARP3Q9Y6F1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PARP3Q9Y6F1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
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