Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y696

CLIC4, Chloride intracellular channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC4Q9Y696 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLIC4Q9Y696 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIC4Q9Y696 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIC4Q9Y696 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIC4Q9Y696 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIC4Q9Y696 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIC4Q9Y696 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIC4Q9Y696 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIC4Q9Y696 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIC4Q9Y696 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIC4Q9Y696 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIC4Q9Y696 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIC4Q9Y696 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIC4Q9Y696 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIC4Q9Y696 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIC4Q9Y696 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIC4Q9Y696 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIC4Q9Y696 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIC4Q9Y696 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIC4Q9Y696 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIC4Q9Y696 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIC4Q9Y696 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIC4Q9Y696 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIC4Q9Y696 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIC4Q9Y696 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIC4Q9Y696 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIC4Q9Y696 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIC4Q9Y696 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms