Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A3BPQ9Y5P4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A3BPQ9Y5P4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A3BPQ9Y5P4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A3BPQ9Y5P4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A3BPQ9Y5P4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL4A3BPQ9Y5P4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A3BPQ9Y5P4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A3BPQ9Y5P4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A3BPQ9Y5P4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A3BPQ9Y5P4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A3BPQ9Y5P4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A3BPQ9Y5P4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A3BPQ9Y5P4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A3BPQ9Y5P4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A3BPQ9Y5P4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A3BPQ9Y5P4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A3BPQ9Y5P4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A3BPQ9Y5P4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A3BPQ9Y5P4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A3BPQ9Y5P4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A3BPQ9Y5P4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A3BPQ9Y5P4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A3BPQ9Y5P4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A3BPQ9Y5P4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A3BPQ9Y5P4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A3BPQ9Y5P4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A3BPQ9Y5P4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL4A3BPQ9Y5P4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
COL4A3BPQ9Y5P4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms