Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4G8

RAPGEF2, Rap guanine nucleotide exchange factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF2Q9Y4G8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC36.71■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
RAPGEF2Q9Y4G8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
RAPGEF2Q9Y4G8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
RAPGEF2Q9Y4G8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
RAPGEF2Q9Y4G8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
RAPGEF2Q9Y4G8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
RAPGEF2Q9Y4G8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
RAPGEF2Q9Y4G8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
RAPGEF2Q9Y4G8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
RAPGEF2Q9Y4G8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
RAPGEF2Q9Y4G8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
RAPGEF2Q9Y4G8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
RAPGEF2Q9Y4G8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
RAPGEF2Q9Y4G8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
RAPGEF2Q9Y4G8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
RAPGEF2Q9Y4G8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC36.68■■■■□ 3.46
RAPGEF2Q9Y4G8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
RAPGEF2Q9Y4G8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
RAPGEF2Q9Y4G8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
RAPGEF2Q9Y4G8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
RAPGEF2Q9Y4G8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
RAPGEF2Q9Y4G8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
RAPGEF2Q9Y4G8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
RAPGEF2Q9Y4G8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
RAPGEF2Q9Y4G8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
RAPGEF2Q9Y4G8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
RAPGEF2Q9Y4G8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
RAPGEF2Q9Y4G8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RAPGEF2Q9Y4G8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RAPGEF2Q9Y4G8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
RAPGEF2Q9Y4G8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RAPGEF2Q9Y4G8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
RAPGEF2Q9Y4G8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
RAPGEF2Q9Y4G8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC36.64■■■■□ 3.46
RAPGEF2Q9Y4G8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
RAPGEF2Q9Y4G8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC36.62■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms