Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHMP3Q9Y3E7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHMP3Q9Y3E7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHMP3Q9Y3E7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms