Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PRELID3BQ9Y3B1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms